No Projeto Escola Plural, o ICEAFRO tem incentivado a formação de novos quadros acadêmicos negros, através da sua Pós-graduação latu sensu, em Educação e Desigualdades Raciais que, entre 2003 e 2004, realizou a 1ª Turma com o apoio da Fundação Ford e, em 2008, a 2ª Turma, com o apoio da SEPPIR. Este Curso tem a chancela acadêmica do Programa de Pós-Graduação em História da FFCH da UFBA.
